Đơn vị sự nghiệp công lập tự bảo đảm một phần chi thường xuyên phải nộp thuế thu nhập doanh nghiệp đối với thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ, trừ các khoản thu nhập được miễn thuế theo quy định của pháp luật về thuế.
1. Đơn vị sự nghiệp tự bảo đảm một phần chi thường xuyên là gì?
Theo Nghị định 60/2021/NĐ-CP quy định cơ chế tự chủ tài chính của đơn vị sự nghiệp công lập, đơn vị sự nghiệp công tự bảo đảm một phần chi thường xuyên là đơn vị có nguồn thu sự nghiệp bảo đảm một phần chi thường xuyên, phần còn lại do ngân sách nhà nước cấp.
2. Nghĩa vụ thuế thu nhập doanh nghiệp của đơn vị sự nghiệp công lập
Theo Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 67/2025/QH15 và Nghị định 320/2025/NĐ-CP, đơn vị sự nghiệp công lập có hoạt động sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ có thu nhập chịu thuế là người nộp thuế thu nhập doanh nghiệp.
Cụ thể:
- Thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh, dịch vụ của đơn vị sự nghiệp phải kê khai, nộp thuế thu nhập doanh nghiệp theo quy định;
- Kinh phí ngân sách nhà nước cấp để thực hiện nhiệm vụ chính trị, sự nghiệp không phải là thu nhập chịu thuế thu nhập doanh nghiệp;
- Đơn vị được trừ các khoản chi được trừ khi xác định thu nhập chịu thuế nếu đáp ứng điều kiện về hóa đơn, chứng từ và thanh toán theo quy định.
3. Kê khai, nộp thuế thu nhập doanh nghiệp
Đơn vị sự nghiệp công lập thực hiện đăng ký thuế, kê khai và nộp thuế thu nhập doanh nghiệp theo quy định của Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15 (có hiệu lực từ ngày 01/7/2026, thay thế Luật Quản lý thuế 2019). Đơn vị cần hạch toán riêng thu nhập từ hoạt động sản xuất, kinh doanh chịu thuế và các khoản thu, chi từ nguồn ngân sách nhà nước.
Lưu ý khi áp dụng
Các hướng dẫn về thuế đối với đơn vị sự nghiệp công lập ban hành trước đây (như Thông tư 150/2010/TT-BTC) cần được đối chiếu với khung pháp luật hiện hành, đặc biệt là Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp 2025 và cơ chế tự chủ tài chính theo Nghị định 60/2021/NĐ-CP.
Rủi ro thường gặp cần lưu ý
- Không hạch toán riêng hoạt động kinh doanh chịu thuế và hoạt động sự nghiệp dùng ngân sách;
- Bỏ sót nghĩa vụ kê khai thuế thu nhập doanh nghiệp đối với các khoản thu dịch vụ;
- Áp dụng nhầm văn bản hướng dẫn đã hết hiệu lực.
ANT Legal có thể hỗ trợ gì?
ANT Legal hỗ trợ rà soát nghĩa vụ thuế của đơn vị sự nghiệp công lập, xác định thu nhập chịu thuế và tư vấn tuân thủ. Để được tư vấn, Quý khách có thể liên hệ luật sư của ANT Legal.
